天台宗の開祖最澄（伝教大師）とその弟子円仁（慈覚大師）が神戸の地に立ち寄られ、近江国坂本（滋賀県大津市）の現「山王総本宮日吉大社」の七柱の神々（山王七社）を影向山神護寺（善學院）内に祀ったことを始まりとする、１２００年以上の歴史と多くの重要文化財を保有する旧県社（岐阜県での現社格は金幣社）です。
多くの神々を祀り、幅広いご利益を授け、人々の生活に深く関わっています。
弘仁８年（８１７）最澄は、東国へ天台宗を広める旅の途次、神戸の地に立ち寄られました。このとき最澄は、神戸付近を治めていた「安八太夫安次」の願いにより、善学院を建て、近江国（滋賀県）坂本の山王権現（ごんげん）を勧請（かんじょう）して祀り、その神々の宮居（みやい）を「日𠮷新宮」と名付けられたといわれています。（日𠮷新宮山王権現鎮座の由緒）
日𠮷神社には上七社・中七社・下七社の山王二十一社をはじめ多くの神々が祀られており、それら全体で日𠮷神社を構成していますが、次の七つの宮（上七社）がよく知られています。
四月下旬の土、日曜日に行われる「神戸山王まつり」に担がれる神輿（みこし）は、上七社の神々が旅（渡御：とぎょ）をされるときにお乗りになるものです。
日𠮷神社ができたころは、神と仏は一体であると説かれていたので、国の重要文化財である三重塔・十一面面観世音菩薩像・地蔵菩薩像やその他の仏教関係のものが神社に残っています。
